SNP位点rs6858698对慢性淋巴细胞白血病易感性的影响
【出 处】:
【作 者】:
武佳玉
刘松
王晓月
【摘 要】目的 探讨rs6858698位点的功能活性及其对慢性淋巴细胞白血病易感性的影响.方法 双荧光素酶报告基因系统检测含有rs6858698位点的DNA片段的调控活性.利用CRISPR/Cas9系统在HEK293T细胞内构建点突变的稳定细胞株.全转录组测序分析(RNA-seq)不同基因型的细胞株之间的基因表达差异情况.并用实时定量PCR(RT-qPCR)和CRISPR干扰实验(CRISPRi)对RNA-seq的结果进行验证.结果 rs6858698-C DNA片段的调控活性约是rs6858698-G DNA片段的调控活性的1.69倍.转录组测序分析在两种基因型的细胞中共鉴定出140个差异表达的基因(P<0.05),其中有87个基因表达下调,53个基因表达上调.差异表达基因主要富集在9个生物学过程.RT-qPCR和CRISPRi实验的验证结果与RNA-seq的结果一致.结论 SNP位点rs6858698具有调控功能,可以通过影响与表观修饰相关的基因的表达,进而影响个体对慢性淋巴细胞白血病的易感性.
相关热词搜索: rs6858698 CRISPR RNA-seq 慢性淋巴细胞白血病
上一篇: 槲皮素促进小鼠脊髓损伤后巨噬细胞表型转变及功能恢复
下一篇: Zika病毒NS3具有依赖于ATP水解的dsDNA解链活性